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RD-Embed est un cadre de représentation unifié en trois étapes qui améliore significativement la récupération et le diagnostic des maladies rares à partir de dossiers cliniques hétérogènes en alignant les textes cliniques et les signaux SNOMED via un apprentissage graphique, surpassant ainsi les modèles d'embedding et les grands modèles de langage existants.
Cette étude révèle une forte architecture génétique partagée entre la dépression majeure et la douleur chronique en identifiant 375 loci communs et des mécanismes moléculaires spécifiques dans le cerveau, offrant ainsi de nouvelles cibles potentielles pour la prévention et le traitement de cette comorbidité.
Cette étude de cas-témoins menée sur de grandes cohortes populationnelles démontre que la détection génomique des variants pathogènes PALB2 identifie un risque accru de cancers (notamment du sein et du pancréas) et une mortalité plus élevée, bien que ces risques soient inférieurs aux estimations issues de la détection familiale.
Cette étude présente une méthode non invasive de dépistage génétique préimplantatoire utilisant l'ADN libre du milieu de culture embryonnaire, qui, grâce à une amplification génomique linéaire réingénierée et un algorithme bayésien, a démontré une précision diagnostique parfaite pour les maladies monogéniques et une faisabilité pour l'évaluation des risques polygéniques, sans nécessiter de biopsie invasive ni modifier les protocoles de fécondation in vitro.
Cette étude démontre que des variants bialléliques de WDR91 provoquent un trouble neurodéveloppemental sévère en perturbant la maturation endosomale et la régulation de l'autophagie, ce qui est confirmé par l'analyse fonctionnelle de variants de perte de fonction chez un patient atteint de microcéphalie progressive et d'épilepsie précoce.
Cette étude qualitative et par sondage identifie les lacunes de connaissances, les préoccupations (notamment liées à l'assurance et à la famille) et les besoins de communication des hommes concernant le dépistage génétique germinel du cancer de la prostate, afin de concevoir et d'évaluer un outil d'information visant à faciliter leur prise de décision éclairée.
Cette étude utilise un fine-mapping génomique informé par la fonctionnalité sur plus d'un million de personnes pour identifier des variants causaux et des voies biologiques clés, révélant que le risque de maladie coronarienne est principalement piloté par la dysrégulation du métabolisme des lipoprotéines, de l'homéostasie vasculaire et des réponses au stress cellulaire.
Cette étude identifie une expansion de répétitions CCG dans le 5' UTR du gène TBC1D7 comme une nouvelle cause génétique de la myopathie oculopharyngodistale chez des patients d'ascendance européenne et mixte, révélant un mécanisme de gain de fonction toxique dominant et soulignant l'importance de l'analyse systématique des expansions de répétitions non codantes dans les maladies neuromusculaires.
Cette étude de génomique à l'échelle du génome identifie de nouveaux régulateurs de la résistance à l'insuline, mettant en évidence le dysfonctionnement du tissu adipeux et des voies systémiques comme mécanismes centraux pour le développement de nouvelles cibles thérapeutiques.
L'étude du registre russe de la dystrophie musculaire facioscapulohumérale (FSHD), qui inclut 470 participants, révèle une cohorte plus jeune que les données internationales avec une prédominance de patients porteurs de 3 répétitions D4Z4 et identifie trois trajectoires de maladie distinctes permettant une meilleure stratification des patients.
Cette étude intègre des données multi-omiques à l'échelle cellulaire avec des études d'association pangénomique pour prioriser des gènes candidats druggables et révéler des effets causaux spécifiques à certains types cellulaires, notamment dans les astrocytes et les précurseurs d'oligodendrocytes, afin d'éclairer les mécanismes de la gliomagenèse et d'améliorer les thérapies de précision contre le glioblastome.
SafeGene est une nouvelle plateforme informatique bilingue développée pour le Royaume d'Arabie saoudite et les États du CCG, qui améliore le dépistage génétique prénuptial en intégrant des modèles d'hérédité mendélienne, des données génétiques spécifiques à la région et une analyse des coefficients de consanguinité afin de prédire les risques de maladies pour la descendance.
Cette étude démontre, grâce à une modélisation génétique sexospécifique de 2 millions de personnes, que la composante génétique de l'adiposité chez les femmes, distincte de celle des hommes, active des voies hormonales et oncogènes spécifiques qui expliquent mécanistiquement le risque accru de cancer de l'endomètre.
Cette étude démontre, en combinant une modélisation moléculaire par intelligence artificielle et des essais cellulaires, que la variante rare E431K du gène TGFBR2 altère la stabilité de la protéine et la signalisation TGF-{beta}, confirmant ainsi le diagnostic du syndrome de Loeys-Dietz chez un patient.
En partenariat avec 18 organisations de patients, cette étude a développé l'outil GeniE pour estimer la prévalence génétique de 22 maladies récessives à partir des données gnomAD, démontrant ainsi comment la collaboration entre la science et le plaidoyer des patients permet de générer des données dynamiques et actionnables pour le développement thérapeutique.
Cette étude prospective multi-institutionnelle démontre que le score de diversité des motifs régionaux (rMDS), une nouvelle métrique fragmentomique basée sur les extrémités de l'ADN circulant, permet de distinguer avec une grande précision les patients atteints de cancer de la tête et du cou répondant à l'immunothérapie de ceux qui n'y répondent pas, surpassant les biomarqueurs établis et offrant une valeur pronostique significative.
Cette étude de génétique des populations, menée sur des millions de participants d'origines diverses, révèle que la vulnérabilité génétique partagée entre les troubles internalisés (dépression, anxiété généralisée et stress post-traumatique) repose sur des mécanismes cellulaires généraux, tandis que les risques spécifiques à chaque trouble impliquent des perturbations plus spécialisées dans les voies neurodéveloppementales, synaptiques et de réponse au stress.
Cette étude présente le développement et la validation d'une méthode LC-MS/MS quantitative et réglementaire pour doser l'héparane sulfate dans le liquide céphalorachidien, offrant ainsi un biomarqueur fiable pour le diagnostic, le suivi et l'évaluation thérapeutique de la mucopolysaccharidose de type IIIA.
Cette étude établit que le gène FRMPD4, déjà associé à un handicap intellectuel et à l'épilepsie, est également une cause de surdité neurosensorielle non syndromique liée à l'X, en démontrant son rôle évolutivement conservé dans la fonction auditive grâce à des analyses cliniques et des modèles animaux.
Cette étude présente la première caractérisation intégrative à grande échelle du génome et du transcriptome de plus de 500 tumeurs mammaires indiennes, révélant des sous-types cliniquement actionnaires distincts, de nouveaux gènes mutés et des signatures transcriptionnelles qui améliorent la compréhension de la biologie tumorale et les stratégies de médecine de précision pour cette population sous-représentée.